แอนติบอดีเป็นโปรตีน หนัก (~150 k Da ) ที่ มีขนาดประมาณ 10 นาโนเมตร[7] จัดอยู่ใน บริเวณ ทรงกลม สาม ส่วนซึ่งก่อตัวเป็นรูปตัว Y คร่าวๆ
ในมนุษย์และสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนม ส่วนใหญ่ หน่วยแอนติบอดีประกอบด้วยสายโพลีเปปไทด์สี่ สาย สายหนักที่เหมือนกันสอง สายและสาย เบาที่เหมือนกันสอง แอนติบอดี สายที่ เชื่อมต่อกันด้วยพันธะไดซัลไฟด์ [8] แต่ละสายเป็นชุดของโดเมน : มีลำดับที่ค่อนข้างคล้ายคลึงกันซึ่งแต่ละสายมีกรดอะมิโนประมาณ110 ตัว โดเมนเหล่านี้มักจะแสดงเป็นแผนผังอย่างง่ายเป็นรูปสี่เหลี่ยมผืนผ้า สายเบาประกอบด้วยโดเมนแปรผันหนึ่งโดเมน V Lและโดเมนคงที่หนึ่งโดเมน C Lในขณะที่สายหนักประกอบด้วยโดเมนที่แปรผันได้หนึ่งโดเมน V Hและโดเมนคงที่สามถึงสี่โดเมน